
空間トランスクリプトーム受託解析
1)高空間分解能 × 広視野
500 nm級(サブミクロン)の高分解能で微細構造に伴う発現変化をとらえつつ、cm級の広視野で組織全体の空間パターンも同時に解析可能です。
局所~全体まで、スケール横断で理解したい研究に適しています。
2)バイアスの少ない全トランスクリプトーム解析
標的遺伝子に依存しないアプローチで、全トランスクリプトームを網羅的に取得。
ヒト・マウスに加え、参照ゲノムが利用可能な幅広い真核生物のサンプルにも対応します。
3)FFPEサンプルにも対応(品質評価込み)
Fresh Frozenはもちろん、FFPEサンプルにも対応。
解析前にrRNA除去やDV200、β-actin in situ, in situ RT法などを用いた多角的なRNA品質評価を行い、サンプル状態に応じて最適な手段をご提案します。
4)Certified Service Providerの認証取得
STOmics TechよりCertified Service Providerの認証取得しております。
5)自社シーケンスによるサービスの提供
自社シーケンスでのSTOmicsフル受託サービスを提供しております。
測定原理と実験ワークフロー
① DNBパターンチップ
② CIDシーケンシング
③ Stereo-seqチップ
④ In situ RNAキャプチャ
⑤ ライブラリー構築とシーケンス
⑥ 空間トランスクリプトーム解析
事前確認事項(サンプル受け入れ条件)
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マウント済みP&T slideを送付(切片作成はお客様が実施)
IGT実施内容:透過条件検討(1サンプルあたり最大4タイムポイント)
ssDNA染色画像取得、ライブラリ調製、シーケンス、SAW解析
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新鮮凍結組織包理済みブロック(切片作成からIGTに依頼)
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マウント済みN slide(切片作成はお客様が実施)
IGT実施内容:ssDNA染色画像取得、ライブラリ調整、シーケンス、SAW解析
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ホルマリン固定した組織(切片作製からIGTに依頼)
ご依頼方法・価格については
以下よりお問い合わせください
サンプル送付方法
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サンプルは乾燥・液漏れが無いようご注意いただき、下記発送先までご送付ください (平日17時到着まで対応可能)
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凍結細胞・組織をご発送の場合は、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください
* 遠隔地を除き翌日必着でご送付ください
サンプル送付先
〒277-0882
千葉県柏市柏の葉6丁目6番2号
三井リンクラボ柏の葉1 304号室
TEL:04-7192-8732
イムノジェネテクス株式会社
納期
サンプル受領から
2.5ヶ月程度
納品物 (HDD)
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作業報告書
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シーケンス生データ一式
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マッピング結果ファイル(遺伝子発現テーブル並びにRNA velocity解析用発現テーブル、解析レポートファイル等)
シーケンスデータから1細胞ごとの遺伝子発現テーブルを作成いたします
報告書を抜粋したもの をご確認いただけます
報告書のうちSeurat解析のレポートはオプションとなり、別途費用をいただきます
報告書の例としてオプション解析も含めた場合を、Latest Dataからご覧いただけます
