TCRレパトア解析
TCRレパトアは個体の抗原感作歴や､様々な病原体に対する個体の対応可能性を反映する"免疫記憶バーコード"
T細胞は､病原微生物やがん等の抗原を認識するT細胞受容体(TCR) を発現しています。TCR遺伝子には遺伝子再構成により膨大な種類が生み出され､同じ種類のTCR遺伝子を持つT細胞をクローンと呼びます｡がんや感染症､自己免疫疾患などで特定のT細胞クローンが抗原を認識して増殖するクローン性増殖が起こると､特定の種類のクローンの頻度が高くなった集団が形成されます｡T細胞が集団として持っているTCR遺伝子のコレクション (クローンの種類と個々のクローンの頻度) をTCRレパトアと呼び､これを次世代DNAシーケンサーなどで解析する手法がTCRレパトア解析です｡
TCRレパトアは個体の抗原感作歴を反映する“免疫記憶バーコード”として､また多様な病原体に対する個体の対応可能性を反映する指標として､がん､自己免疫疾患､感染症､そしてワクチン応答などの研究･診断への応用が期待されています｡
胸腺におけるTCR遺伝子の再構成と
クローン選択
正と負の選択による機能的かつ安全なクローンの選択
末梢組織で病原体､がん､自己抗原などに
反応したクローンのクローン性増殖
頻度と認識抗原の異なる様々なクローンから成るTCRレパトア
高感度、非バイアス
mRNAからcDNAを合成し､共通プライマーでTCR遺伝子を増幅することで､cDNAをスタートとして可変領域に対するmultiple primerで増幅する系に比較して高感度､非バイアスな解析が可能です｡また､休止期のT細胞はTCR遺伝子発現量が低く (数コピー/細胞程度)､レパトア解析には検出感度が求められますが､IGT社の増幅法は既存技術の中でも特に感度の優れた方法を採用しています。
腫瘍浸潤T細胞の重複クローン解析
がん組織でのCD4/CD8レパトア解析：
TCRレパトア解析ではCD4+ T細胞 とCD8+ T細胞を分画して解析することが極めて重要です。一方、がんの生検組織などからのT細胞サブセットの精製は技術的、時間的に大きな負担です。IGT社では、患者の末梢血CD4+ T細胞およびCD8+ T細胞のTCRレパトアに基づき、CD4またはCD8に属するクローンのリストを作成し、未分画腫瘍組織のTCRレパトアに存在するクローンがCD4とCD8いずれかを判定する重複クローン解析技術を開発しました（特許申請中）。
この重複クローン解析技術により、腫瘍反応性CD4+およびCD8+ T細胞クローンの治療前後または経時的な変化を容易に解析することが可能になりました。
* 末梢血単核球からのCD4、CD8T細胞の分画オプションもございます。
他社従来法末梢血TCR解析
腫瘍関連T細胞は末梢血の一部にしか存在しないので
評価が難しい
IGT社末梢血･腫瘍重複TCR解析
どのような施設でも､診断で採取した末梢血､腫瘍生検を
IGT社に送ると特異的な抗腫瘍T細胞応答を評価できる
従来の腫瘍浸潤T細胞レパトア解析
簡便だが免疫学的な解釈ができない
免疫学的な解釈を可能にするために､時間と特殊技術が必要
腫瘍･末梢血重複クローン解析技術による
汎用性の高い腫瘍浸潤CD4/CD8T細胞レパトア解析
情報解析
* T細胞免疫の専門家が研究目的に応じたサンプル設定・解析のアドバイスをするオプションもございます。
mRNA捕捉･逆転写
アダプター付加･
2本鎖DNA合成
TCR遺伝子増幅
NGS用TCRライブラリー
ご依頼方法
サンプルの受け入れ
・
精製済みtotal RNA
・
当社指定の溶解液へ溶解して頂いた細胞溶解液
・
・
未分画凍結細胞検体（IGT社でT細胞の調製以降を受託）
・
凍結保存組織検体（IGT社で細胞懸濁液調製以降を受託)
サンプル送付先
〒277-0882
千葉県柏市柏の葉6丁目6番2号
三井リンクラボ柏の葉１ 304号室
TEL：04-7192-8732
イムノジェネテクス株式会社
サンプル送付方法
・
サンプルは乾燥･液漏れが無いようご注意いただき､下記発送先までご送付ください （平日17時到着まで対応可能）
・
送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください
納期
サンプル受領から
2.5ヶ月程度
納品物
・
作業報告書
・
シーケンスデータ一式
・
マッピング結果ファイル 等
参考価格
サンプル数
価格 (税込)
1
¥99,000
4
¥360,800
8
¥642,400
Clonal spreading of tumor-infiltrating T cells underlies the robust antitumor immune responses
Transient Depletion of CD4+ Cells Induces Remodeling of the TCR Repertoire in Gastrointestinal Cancer
First-in-human phase 1 study of IT1208, a defucosylated humanized anti-CD4 depleting antibody, in patients with advanced solid tumors
TCR Repertoire Analysis Reveals Mobilization of Novel CD8+ T Cell Clones Into the Cancer-Immunity Cycle Following Anti-CD4 Antibody Administration